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近年來，微量高通量微生物篩選法已在歐洲等實驗室采用。其基本方法是以96孔微孔板作大量培養的容器，每孔可先加入一.定量的培養液，再用多點（12點）接種器快速接種純菌株，每小時約可接40000個不同變異株，每天可篩選2萬~3萬株，經適當培養后，可快速對每孔中的代謝產物進行自動檢測，工效高。

使用深孔板或微孔板，可以獲得足夠數量的蛋白質，用于后續平行批次的分析，并且可以減少蕞終流程之前的步驟數量。

1、3mm振幅結合高攪拌（振蕩）速度

即使在小型培養容器中，為了實現氧化和混合，需要一個適合此要求的小振幅，以及高達1000 min-1的攪拌速度。同時，所需的液體體積較小，從而降低了培養基的成本。

2、大容量培養搖床

為了盡可能有效地利用有限的實驗室空間進行篩選應用，可以使用多個疊加搖床。向下打開箱門大大節省了空間，并且幾乎不需要額外的空間用于連接、通風和維護。

3、配備適當的搖床

只有在適宜的培養條件下，高.效篩選才能成功。其中包括溫度均勻性、J確的CO2調節和冷卻以及無冷凝水加濕。這可以防止液體通過蒸發而損失，這就是它不可少的原因，特別是在小體積的微孔板和深孔板的情況下。在篩選細胞培養物時，還建議考慮搖床的衛生設計，例如抗菌表面，可以防止污染。

 
4、與自動化處理解決方案兼容

孔板培養可借助液體處理設備進行自動處理，然后在孔板評估分析設備的幫助下對其進行分析結果。可以節省時間、體力、也可以節省成本。